1、遗传因素：
2、内分泌紊乱：
3、环境因素：
4、药物干扰：母亲孕早期服用抗癫痫药发生泌尿系统畸形明显升高，其中丙戊酸钠主要与尿道下裂及肢体短缺发病相关。
5、染色体异常：在尿道下裂患者中的染色体畸变率较正常人群有明显增高，其中包括有常染色体畸变及性染色体畸变。
6、基因突变：
1。尿道开口在阴茎中段或者在阴囊与阴茎交接处。
2。包皮只覆盖龟头背侧，阴茎的腹侧没有包皮。
3。阴茎弯曲，勃起时弯曲更明显。
4。尿道下裂有时合并隐睾症。严重的尿道下裂，如开口在会阴的，再加上双侧隐睾症，会产生性别判定的困难，须检查染色体才能知道确实的性别。尿道下裂的小朋友有较多的机会得到疝气。
手术矫治是有效方法。
博爱推荐Snodgrass法尿道下裂成形术(TIP)
1、切口于阴茎腹侧围绕尿道口做两条平行斜切口，间距约为阴茎周径的1/3，两切口斜向阴茎背侧直达冠状沟，可略超过背侧中线。然后连接在一起，此为形成皮管的皮瓣C。
2、阴茎伸直、尿道成形 先沿冠状沟做一附加切口，使成皮瓣A。将A瓣掀起，显露阴茎腹侧中央的纤维束带，予以彻底切除，充分伸直阴茎。然后自尿道口置入导尿管，将C瓣周缘稍事分离后包绕导尿管，形成创面朝外的管状，用5-0尼龙线或丝线间断缝合，线结打在管道内面，令其术后自行脱落。于阴茎头做一隧道，将已制成的管道远端埋入隧道内，管道外口与阴茎头创缘缝合固定。如此形成的尿道虽略有弯曲，但不影响尿流通畅。
3、封闭创面，分离A、B瓣，并于冠状沟做附加横切口，将皮瓣向腹侧中央拉拢对合后做两排缝合(同皮条埋藏尿道成形术)。术终，拔出导尿管，于新形成的尿道口置放胶皮片引流条，用牵引线或细钢丝固定阴茎于腹壁上。
尿道下裂手术后的护理要点：
1、按麻醉术后护理常规。
2、仰卧可用护架保护，防止局部受压，在阴茎敷料外用0。5～1kg沙袋压迫，防止切口渗血，减轻水肿，若行尿道海绵体提升者毋须沙袋压迫。
3、注意膀胱造瘘口尿液是否外漏，导尿管通畅，勿扭曲、受压。注意尿液有无血块、沉淀物，集尿袋每日更换1次。
4、术后无渣流质2周，拆线前控制排便，可口服樟脑配5滴每日3次，儿童酌量。平时嘱多饮水。
5、为防止术后阴茎勃起，影响切口愈合，每晚给己烯雌酚。
6、术后12天拆线，以后先挟住导尿管，嘱其能自行排尿，后将膀胱造瘘口尿管拔去。
7、手术后如果排尿通畅，有针眼漏尿，患者在排尿时捏住针眼，两个星期后可以自行闭塞，假如漏孔过大，需要半年之后才可以重新修复。
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